Müller había anotado cuatro goles y había hecho dos asistencias durante la competición, camiseta inglaterra lo cual le hizo un goleador para la temporada. Müller inició. Había jugado en los 34 encuentros de la Bundesliga en la temporada, iniciando 29 de ellos, marcando 13 goles y dando 11 asistencias. En febrero de 2009, Müller firmó su primer contrato como profesional con el primer equipo, efectivo desde la temporada 2009-10, junto con su compañero Holger Badstuber, equipacion japon del equipo reserva.